由于所采用的软件系统结构，每个信息服务系统都有不同的服务接口和交互式通信协议。为了实现信息服务系统之间的跨系统协作服务，必须首先遵循以下技术架构要求。
技术体系结构的统一。信息服务系统采用的技术开发手段不同。数据库设计、信息资源组织和服务业务的实现或多或少存在差异，协作服务的实现过程就是要屏蔽这些差异。因此，有必要在不改变其基本技术实现方法的情况下进行统一的技术架构，并确保通过使用统一的网络、软件和硬件架构来连接异构系统中的信息。
技术规范和标准的开放性。在信息服务系统建立之初，就遵循了系统的技术规范和标准，形成了不同系统之间存在差异、不能相互结合的技术规范问题，形成了部门之间的技术规范“信息孤岛”。在跨系统技术协同架构规划阶段，应选择国内外公认、开放、应用广泛、成熟、可扩展的信息技术标准和规范，注重动态适应性。
用户管理的统一。知识创新价值链中的创新主体用户来自不同的创新部门，包括政府管理机构和科研机构的研究人员。同时，企业用户也将是最大的群体。鉴于这种情况，有必要建立一个统一的用户信息管理数据库，对用户信息进行分类管理。
身份验证确保安全。跨系统协作服务的目标是满足用户的多重信息需求，使用户在获取跨系统信息时与获取单个系统信息时没有区别，使用户可以安全登录各信息服务系统的所有相关业务管理系统，只需一次身份认证，从而实现统一身份认证的管理，同时，一些涉及用户核心机密的需求应确保访问是加密的，以满足其个性化需求。